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【EC運営コストの全貌】知らないと損する費用内訳と相場を解説
EC運営コストの全貌を解説。初期費用と運営費(決済手数料・広告費)の内訳、構築方法別の相場を比較。見落としがちな費用から、コスト削減の視点、運用代行まで網羅。ECサイトの費用最適化に必須の知識がわかります。
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ECサイトの立ち上げや運営を考える際、「一体どれくらいの費用がかかるのだろう?」という不安は多くの事業者が抱える共通の悩みの1つです。
この記事では、ECサイト運営にかかる費用を「初期費用」と「運営費用」の2つに分け、サイトの構築方法による費用の違いから、見落としがちなランニングコストの内訳、事業フェーズ別の費用相場までを網羅的に解説します。
目次
自社ECサイトの運営コストを把握していますか?
ECサイト運営を成功させるためには、売上を伸ばすことと同時に、発生するコストを正確に把握し、適切に管理することが不可欠です。しかし、具体的にどのような費用が、いつ、どれくらい発生するのかを全て把握できているでしょうか。
どんぶり勘定で運営を続けてしまうと、知らないうちに利益を圧迫し、事業の成長を妨げる原因になりかねません。本記事を通じて、自社のECサイト運営にかかるコストの全体像を掴み、利益を最大化するための第一歩を踏み出しましょう。
EC運営コストは2種類!まずは全体像を理解しよう

ECサイトの運営にかかる費用は、大きく分けて「初期費用(イニシャルコスト)」と「運営費用(ランニングコスト)」の2種類に分類されます。まずは、それぞれの費用の性質を理解することが重要です。
これら2つの費用の違いをまとめると、下表のようになります。
| 費用区分 | 概要 | 費用の例 |
|---|---|---|
| 初期費用 | ECサイト開設時に一度だけ発生する費用 | ・サイト制作費 ・デザイン費 ・機材購入費 |
| 運営費用 | サイト運営中に継続的に発生する費用 | ・サーバー代 ・決済手数料 ・広告宣伝費 ・人件費 |
サイト立ち上げに必須の「初期費用(イニシャルコスト)」
初期費用とは、ECサイトを公開するまでに一度だけ発生する費用のことで、「イニシャルコスト」とも呼ばれています。主にサイトの土台を作り上げるための投資と考えると分かりやすいでしょう。主な内訳は次の通りです。
- ECサイト構築費用(デザイン、コーディング、システム開発など)
- PCや周辺機器の購入費用
- ドメイン取得費用
- SSL証明書導入費用
継続的に発生する「運営費用(ランニングコスト)」
運営費用は、ECサイトを運営し続ける限り、毎月または毎年継続的に発生する費用のことで、「ランニングコスト」と呼ばれます。日々のサイト運営を支えるための必要経費を示し、主な内訳は以下の通りです。
- プラットフォーム利用料・サーバー代
- 決済手数料
- 保守費用
- 広告宣伝費
- 商品関連費用(仕入れ、保管、配送など)
- 人件費
【費用比較】ECサイト構築方法で変わる初期費用と月額費用

ECサイトの費用は、どのような方法でサイトを構築するかによって大きく変動します。
ここでは代表的な4つの構築方法の特徴と費用相場を比較します。
- ASPカート
- オープンソース
- ECパッケージ
- フルスクラッチ開発
手軽に始めるなら「ASPカート」
ASP(Application Service Provider)カートとは、ECサイトに必要な機能一式をクラウド上で提供するサービスです。専門知識がなくても比較的簡単にネットショップを開設できるため、個人事業主やスモールスタートを切りたい企業に適しています。
| 項目 | 詳細 |
|---|---|
| メリット | ・低コストで迅速に始められる ・システムのアップデートや保守をサービス提供者に任せられる |
| デメリット | デザインや機能のカスタマイズ性に制限がある |
| 初期費用相場 | 0円~10万円程度 |
| 月額費用相場 | 0円~5万円程度 |
| 特徴 | 専門知識不要でECサイトを構築・運営できる |
| 代表的なサービス | BASE, STORES, Shopify, カラーミーショップなど |
| 向いている事業者 | 個人事業主、小規模事業者、初めてECを始める方 |
デザインの自由度が高い「オープンソース」
オープンソースとは、ソースコードが一般公開されているソフトウェアのことで、EC-CUBEやWordPressのプラグイン(WooCommerce)などが有名です。自由にカスタマイズできる反面、構築や運用には専門的な知識が必要となります。
| 項目 | 詳細 |
|---|---|
| メリット | ・デザインや機能を自由にカスタマイズできる ・ライセンス費用がかからない |
| デメリット | ・サーバーの準備や保守、セキュリティ対策を自社で行う必要がある ・構築に専門知識が必須 |
| 初期費用相場 | 50万円~500万円程度 |
| 月額費用相場 | 1万円~10万円程度(サーバー代、保守費用など) |
| 特徴 | 高いカスタマイズ性を持ち、独自のECサイトを構築可能 |
| 代表的なソフトウェア | EC-CUBE, Magento, WooCommerceなど |
| 向いている事業者 | 独自の機能やデザインを実装したい中規模事業者 |
大規模サイト向けの「ECパッケージ」
ECパッケージは、ECサイト構築に必要な機能をパッケージ化したソフトウェア製品です。ASPカートよりもカスタマイズ性が高く、オープンソースよりも安定した運用が期待でき、中規模から大規模のECサイトでよく採用されます。
| 項目 | 詳細 |
|---|---|
| メリット | ・機能が豊富で拡張性が高い ・セキュリティレベルが高い ・サポート体制が充実している |
| デメリット | 導入費用が高額になる傾向がある |
| 初期費用相場 | 300万円~ |
| 月額費用相場 | 10万円~(保守費用、ライセンス費用など) |
| 特徴 | 豊富な機能と高い拡張性を兼ね備えた中~大規模サイト向け |
| 代表的なサービス | ecbeing, ebisumart, SI Web Shoppingなど |
| 向いている事業者 | 年商数億円以上を目指す中~大規模事業者 |
理想を追求する「フルスクラッチ開発」
フルスクラッチとは、既存のシステムやサービスを利用せず、ゼロから完全にオリジナルのECサイトを開発することです。要件に合わせてあらゆる機能を実装できますが、費用と開発期間は最も大きくなります。
| 項目 | 詳細 |
|---|---|
| メリット | 既存のシステムに縛られず、理想の機能やデザインを完全に実現できる |
| デメリット | ・開発費用が非常に高額になる ・開発期間が長期化する ・運用にも専門知識が必要 |
| 初期費用相場 | 1,000万円~ |
| 月額費用相場 | 数十万円~(保守費用、サーバー代など) |
| 特徴 | 既存の枠にとらわれず、完全に独自のシステムを構築 |
| 代表的なケース | 特殊な販売方法や基幹システムとの複雑な連携が必要な場合 |
| 向いている事業者 | 独自のビジネスモデルを持つ大規模事業者 |
見落としがち?ECサイトのランニングコスト内訳を徹底分解

ECサイト運営では、サイト構築費用以外にも次のような様々なランニングコストが発生します。
| プラットフォーム利用料・サーバー代・決済手数料・保守費用・マーケティング・広告宣伝費・商品関連費用・人件費 など |
ここでは、主なランニングコストの内訳とそれぞれの相場について詳しく解説します。
プラットフォーム利用料・サーバー代
サイトをインターネット上に公開し、安定して稼働させるための費用です。
- ASPカートの場合
月額利用料としてプランごとに定められています。(月額0円~数万円) - オープンソース/パッケージ/フルスクラッチの場合
自社でレンタルサーバーなどを契約する必要があります。(月額数千円~数十万円)
サイトの規模やアクセス数によって必要なスペックが異なり、費用も変動します。
お客様が支払う裏側の「決済手数料」
顧客が商品購入時に利用するクレジットカード決済やコンビニ決済などに対して発生する手数料です。売上に対して一定の料率で課金される変動費となります。
| 決済方法 | 手数料の相場 |
|---|---|
| クレジットカード決済 | 3% ~ 5% |
| コンビニ決済 | 1件あたり100円~200円 + 手数料率 |
| キャリア決済 | 4% ~ 7% |
| 後払い決済 | 4% ~ 6% |
サイトの健康診断「保守費用」の相場は?
システムのアップデートやバグ修正、セキュリティの脆弱性対応など、ECサイトを安全かつ正常に保つための費用です。
- ASPカートの場合
基本的に月額利用料に含まれています。 - オープンソースや独自開発の場合
制作会社に保守を依頼するのが一般的です。費用の相場は、サイトの規模や作業範囲にもよりますが、月額数万円~数十万円程度が目安となります。
売上を左右する「マーケティング・広告宣伝費」
ECサイトへの集客や販売促進のために使われる費用です。売上規模や目標によって大きく変動しますが、一般的には売上の10%~20%を広告宣伝費の目安とすることが多く、主な施策としては次のようなものがあります。
- Web広告(リスティング広告、SNS広告、アフィリエイト広告)
- SEO(検索エンジン最適化)対策
- コンテンツマーケティング(ブログ、オウンドメディア運営)
- SNSアカウント運用
- メールマガジン配信
ECの心臓部!「商品関連費用」(仕入・保管・梱包・配送)
商品の仕入れから顧客の手元に届くまでにかかる一連の費用です。よくある項目には以下のようなものがあります。
| 商品原価・仕入費 | 販売する商品の仕入れにかかる費用 |
| 保管費 | 商品を保管する倉庫の賃料や管理費 |
| 梱包資材費 | ダンボールや緩衝材などの費用 |
| 配送料 | 顧客へ商品を発送するための運送会社への支払い |
意外とかかる「人件費」その適正な比率は?
ECサイトの運営には、商品の登録、受注処理、顧客対応、マーケティングなど多くの業務が付随します。これらの業務を担うスタッフの人件費も大きなコストです。
- 内製する場合:担当者の給与、社会保険料など。
- 外注する場合:業務委託費、運用代行費用など。
人件費の適正な比率は業種や事業規模によって異なりますが、粗利益に対する人件費の割合(労働分配率)を意識することが重要です。
その他(撮影費、ツール利用料など)
上記の他にも必要に応じて様々な費用が発生し、代表的なものとしては、以下のようなものがあります。
- 商品撮影費
プロのカメラマンに依頼する場合の費用(1商品あたり数千円~数万円+スタジオ代など) - ツール利用料
MA(マーケティングオートメーション)ツール、CRM(顧客関係管理)ツール、在庫管理システムなどの月額利用料。
ECサイトの維持費はいくら?運営フェーズ別の費用相場
ECサイトの運営コストは、事業の成長段階によって変化するものです。ここでは「立ち上げ期」「成長期」「安定期」の3つのフェーズに分けて、月商規模ごとの費用相場のイメージを紹介します。
次の表は、ASPカートを利用した場合のコストイメージとなります。
| 立ち上げ期 | 成長期 | 安定期 | |
|---|---|---|---|
| 目標月商 | 50万円 | 300万円 | - |
| コスト | 約7.5万円~ | 約83.5万円~ | 約300万円~ |
| 備考 | コストを抑えながら事業を軌道に乗せることを優先 | より高機能なASPプランへの移行や、業務の外注化を検討する時期 | 更なる拡大に向け、マーケティングやシステムへの投資が本格化 |
※上表はあくまでイメージとなり、事例ではありません。
【立ち上げ期】まずは月商50万円を目指す場合のコスト感
このフェーズでは、コストを抑えながら事業を軌道に乗せることが最優先となります。ASPカートを利用し、運営業務の多くを自分自身で行うケースを想定します。
| 費用項目 | 金額(月額) | 備考 |
|---|---|---|
| プラットフォーム利用料 | 5,000円~1万円 | 有料プランのASPカートを想定 |
| 決済手数料(4%と仮定) | 20,000円 | 売上50万円 × 4% |
| 広告宣伝費 | 50,000円 | 売上の10%を投資 |
| 商品関連費用 | (変動) | 売上原価、配送料など |
| 人件費 | 0円~ | オーナー自身が運営する場合 |
| 合計 ※商品関連費用除く | 約7.5万円~ |
【成長期】月商300万円規模のサイトで必要な投資
売上が拡大するにつれて、集客強化や業務効率化のための投資が必要になります。より高機能なASPプランへの移行や、一部業務の外注化を検討する時期です。
| 費用項目 | 金額(月額) | 備考 |
|---|---|---|
| プラットフォーム利用料 | 3万円~10万円 | 高機能ASPやオープンソースのサーバー代 |
| 決済手数料(3.5%と仮定) | 105,000円 | 売上300万円 × 3.5% |
| 広告宣伝費 | 450,000円 | 売上の15%を投資 |
| 商品関連費用 | (変動) | 売上原価、配送料など |
| 人件費 | 25万円~ | 担当者1名を雇用 |
| 合計 ※商品関連費用除く | 約83.5万円~ |
【安定期】さらなる事業拡大を見据えたコスト戦略
事業が安定し、さらなる拡大を目指すフェーズです。ECパッケージやフルスクラッチへの移行も視野に入り、マーケティングやシステムへの投資が本格化します。
| 費用項目 | 金額(月額) | 備考 |
|---|---|---|
| システム利用・保守費 | 20万円~ | パッケージ利用料や保守費用 |
| 決済手数料(3%と仮定) | 300,000円 | 売上1,000万円 × 3% |
| 広告宣伝費 | 1,500,000円 | 売上の15%を投資 |
| 商品関連費用 | (変動) | 売上原価、配送料、倉庫管理費など |
| 人件費 | 100万円~ | 複数名の専門チームを編成 |
| 合計 ※商品関連費用除く | 約300万円~ |
EC運営コストを賢く抑えるための3つの視点
コストはただ削減すれば良いというものではありません。事業成長に必要な投資は維持しつつ、無駄をなくしていく視点が重要です。この見出しでは、ポイントとなる3つの視点について紹介していきます。
1.固定費と変動費を正しく色分けする
まずは自社のコストを「固定費(売上の増減に関わらず発生する費用)」と「変動費(売上に比例して増減する費用)」に分類しましょう。
- 固定費の例
サーバー代、月額プラットフォーム利用料、人件費(固定給) - 変動費の例
決済手数料、広告宣伝費、配送料、仕入原価
固定費は削減効果が継続するため、契約プランの見直しなどで積極的に最適化を図るべきです。一方、変動費は売上とのバランスを見ながらコントロールする必要があります。
2.業務の自動化で人件費を最適化
受注確認メールの自動送信、在庫数の自動更新、簡単な問い合わせへのチャットボット対応など、定型的な業務をツールで自動化することで、人件費を削減し、スタッフはより創造的な業務に集中できるようになります。
3.費用対効果を意識した広告運用
広告はECサイトの成長に不可欠ですが、やみくもに出稿してもコストがかさむだけです。
ROAS(広告費用対効果)などの指標を常に監視し、効果の高い広告チャネルやクリエイティブに予算を集中させることで、無駄な広告費を削減できます。
専門家への相談も有効な選択肢!EC運用代行とは?
「日々の業務に追われてコスト管理まで手が回らない」「専門的な知識を持つ人材が社内にいない」といった課題を抱えている場合、EC運用のプロフェッショナルである「EC運用代行会社」に業務を委託するのも有効な選択肢となります。

EC運用代行で任せられる業務範囲
代行会社によってサービス範囲は異なりますが、一般的に以下のような業務を依頼することが可能です。
| 業務カテゴリ | 業務詳細 |
|---|---|
| フロント業務 | サイト更新、商品登録、メルマガ作成・配信、キャンペーン企画 |
| バックエンド業務 | 受注処理、在庫管理、顧客対応(カスタマーサポート) |
| マーケティング業務 | 広告運用、SEO対策、SNS運用、アクセス解析 |
| ささげ業務 | 商品の撮影、採寸、原稿作成 |
気になるEC運用代行の料金相場
料金体系は主に「月額固定型」と「成果報酬型」の2つに大別されます。また、この2つを組み合わせた複合型(ハイブリッド型)もあり、運営状況や依頼予算に応じて適切なものを選択すると良いでしょう。
| 料金体系 | 概要 | 料金相場 |
|---|---|---|
| 月額固定型 | 毎月定額の料金で、契約範囲内の業務を代行 | 10万円~50万円程度 |
| 成果報酬型 | 売上や利益の〇%を報酬として支払う | 売上の5%~20%程度 |
| 複合型 | 月額固定料金に加え、成果に応じた報酬を支払う | 月額5万円~ + 成果報酬 |
自社に合った代行会社の選び方
良いパートナーを選ぶためには、以下のポイントを確認しましょう。
- 実績の確認
自社と同じ業界や商材での成功実績があるか。 - 対応範囲の明確化
どこまでの業務を、どのように行ってくれるかが明確か。 - コミュニケーション
報告・連絡・相談がスムーズに行える体制か。 - 料金体系の透明性
料金体系が分かりやすく、追加費用の発生条件などが明確か。
まとめ:EC運営コストを理解し、事業成長を加速させよう
ECサイトの運営には、初期費用から日々のランニングコストまで、実に様々な費用が発生します。これらのコスト構造を正確に理解し、自社の事業フェーズに合わせて適切に管理・最適化していくことが、持続的な事業成長の鍵となります。
まずは、本記事で紹介した費用項目を参考に、自社のコストを洗い出してみることから始めてはいかがでしょうか。見えないコストを可視化することで、利益改善に向けた具体的な次の一手が見えてくるはずです。